GWAS giúp xác định di truyền tính trạng khối lượng hạt đậu nành
GWAS giúp xác định di truyền tính trạng khối lượng hạt đậu nành
Nguồn: Wei Zhang, Wenjing Xu, Hongmei Zhang, Xiaoqing Liu, Xiaoyan Cui, Songsong Li, Li Song, Yuelin Zhu, Xin Chen & Huatao Chen. 2021. Comparative selective signature analysis and high-resolution GWAS reveal a new candidate gene controlling seed weight in soybean. Theoretical and Applied Genetics May 2021; vol. 134:1329–1341.
Người ta tìm thấy một QTL qHSW-16 trong sàng lọc di truyền có chiều sâu có liên quan đến tính trạng khối lượng hạt đậu nành, đây là một gen ứng cử viên mới điều khiển tính trạng KL hạt đậu (seed weight) bởi di truyền số lượng QTL thông qua kỹ thuật qRT-PCT.
Đậu nành [Glycine max (L.) Merr.] cung cấp cho thực phẩm thế giới hơn 50% hàm lượng dầu thực vật. Để khai thác tốt nguồn vật liệu bố mẹ trong ngân hàng gen cây đậu nành, phục vụ cải tiến giống cao sản có chất lượng dầu tốt, người ta cần phải giải quyết nội dung: mức độ đa dạng di truyền và lịch sử tiến hóa cây đậu nành. Kết quả ghi nhận, có 283 mẫu giống đậu nành được chạy trình tự theo kỹ thuật resequencing có nguồn gốc ở Trung Quốc. Chúng được chạy với số lượng lớn chỉ thị phân tử SNPs chất lượng cao để nghiên cứu di truyền quần thể. Nguòi ta xem xét biến thiên di truyền của tính trạng khối lượng hạt that và những tính trạng nông học khác. Phân tích SSA (selective signature analysis) tìm thấy được tín hiệu chọn lọc mới mang tính giả định là 78 (~ 25.0 Mb) trong thời kỳ đậu nành thuần hóa và 39 (~ 22.60 Mb) trong thời kỳ người ta cải tiến giống đậu nành. Kết quả GWAS (genome-wide association study) đã xác định được năm loci liên quan đến tính trạng KL hạt. Trong những QTLs này, qHSW-16 chồng lên vùng có tính chọn lọc cải tiến, trên nhiễm sắc thể 16, cho thấy rằng: QTL này có thể khắc phục sự chọn lọc rất mạnh mẽ trong giai đoạn cải tiến giống đậu nành. Trong 18 gen ứng cử viên, thuộc qHSW-16, chỉ có gen SoyZH13_16G122400 biện hiện ra ở mức độ cao đối với giống đậu nành hạt to so với giống đậu nành hạt bé trong giai đoạn hạt phát triển. Người ta phân lập được gen SoyZH13_16G122400 như một gen ứng cử viên mới điều khiển khối lượng hạt và cung cấp những hiểu biết di truyền các điểm đích ở quy mô phân tử phục vụ cải tiến giống đậu nành cao sản có hạt nặng theo mong muốn.
Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-021-03774-6
Comments
Post a Comment