Thực hiện “fine mappping” gen AhRt1 quy định màu vỏ lụa đậu phộng
Thực hiện “fine mappping” gen AhRt1 quy định màu vỏ lụa đậu phộng
Nguồn: Hao Chen, Xiangyu Chen, Rirong Xu, Wenjing Liu, Nian Liu, Li Huang, Huaiyong Luo, Dongxin Huai, Xinlong Lan, Yumei Zhang, Runfang Hu, Jianhong Chen, Zhaoxiu Tang, Guoqiang Lin & Huifang Jiang. 2021. Fine-mapping and gene candidate analysis for AhRt1, a major dominant locus responsible for testa color in cultivated peanut. Theoretical and Applied Genetics November 2021; vol. 134: 3721–3730
Gen AhRt1 điều khiển tính trạng màu vỏ lụa đỏ (red testa color) của đậu phông. Gen này được tiến hành phân tích “fine-mapped” ở quãng phân tử có độ lớn 580 kb trên nhiễm sắc thể A03, và một gen khác mã hóa yếu tố phiên mã bHLH. Chúng được xác định là những gen ứng cử viên.
Giống đậu phông có vỏ lụa màu đỏ biểu hiện giá trị dinh dưỡng và giá trị kinh tế cao hơn giống đậu phông cổ truyền có vỏ lụa màu tím. Người ta xác định những gen điều khiển tính trạng red testa color, điều này sẽ làm phát triển tốt hơn chương trình lai tạo giống mới, trên cơ sở cơ chế di truyền được xác định. Theo kết quả nghiên cứu này, người ta muốn phân lập gen đích quy định tính trạng red testa color của đậu phụng, một quần thể con lai F2 được phát triển từ cặp lai giữa giống đậu phông có vỏ lụa màu tím “Fuhua 8” với một giống có vỏ lụa đỏ “Quanhonghua 1”. Phân tích di truyền từ quần thể F2 cho thấy rằng: tính trạng red testa color được điều khiển bởi một gen trội. Locus này có tên là AhRt1 (Arachis hypogaea Red Testa 1), locus này lần đầu tiên được phân lập trên nhiễm sắc thể A03 thông qua kỹ thuật chạy BSA-sequencing. Sử dụng quần thể con lai đang phân ly, gen AhRt1 được "fine-mapped" ở vùng có độ lớn phân tử 580-kb thông qua phương pháp substitution mapping. Phân tích gen ứng cử viên cho thấy có một gen được dự đoán mã hóa yếu tố phiên mã bHLH. Đây có thể là một gen ứng cử viên đối với AhRt1. Một chỉ thị phân tử có tính chất diagnostic liên kết chặt chẽ với gen ứng cử viên này cũng được phát triển để minh chứng kết quả fine-mapping trong những quần thể con lai khác và trong ngân hàng vật liệu giống đậu phông. Phát hiện của tác giả công trình này sẽ có lợi cho chương trình cải tiến giống đậu phụng để phát triển giống mới có vỏ lụa màu đỏ và đặt nền tảng cho map-based cloning gene đáp ứng với mục tiêu cải tiến đậu phông có vỏ lụa hạt đỏ.
Xem: https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-021-03924-w
Comments
Post a Comment