AhRT2  là gen ứng cử viên của tính trạng màu vỏ lụa đỏ của hạt đậu phụng

 AhRT2  là gen ứng cử viên của tính trạng màu vỏ lụa đỏ của hạt đậu phụng

Nguồn: Kun Zhang, Mei Yuan, Han Xia, Liangqiong He, Jing Ma, Mingxiao Wang, Huiling Zhao, Lei Hou, Shuzhen Zhao, Pengcheng Li, Ruizheng Tian, Jiaowen Pan, Guanghui Li, Mahendar Thudi, Changle Ma, Xingjun Wang & Chuanzhi Zhao. 2022. BSA‑seq and genetic mapping reveals AhRt2 as a candidate gene responsible for red testa of peanut. Theoretical and Applied Genetics: May 2022; vol. 135: 1529–1540

Gen lặn ứng cử viên ahRt2 có chức năng điều khiển tính trạng màu vỏ lụa đỏ (red testa) của đậu phụng thông qua kết quả phối hợp của BSA-seq và bản đồ liên kết.

Màu vỏ lụa đỏ (testa color) của đậu phụng (Arachis hypogaea L.) la tính trạng nông học quan trọng, red testa đặc biệt phổ biến theo thị hiếu người tiêu dùng, là kết quả của hàm lượng cao anthocyanin. Tuy nhiên, việc xác định các gen có liên quan đến điều tiết tính trạng red testa này trong hệ gen đậu phụng rất ít được báo cáo khoa học. Để thực hiện fine map gen điều khiển màu vỏ lụa đỏ, người ta tiến hành tạo ra hai quần thể F2:4  thông qua tổ hợp hai giữa YZ9102 (testa màu hồng) x ZH12 (testa) và YZ910 x ZH2 (testa đỏ). Kết quả phân tích di truyền cho thấy testa màu đỏ được điều khiển bởi một gen lặn ahRt2 (Red testa gene 2). Kết quả BSA-seq cho thấy ahRt2 được phân lập trên nhiễm sắc thể 12, rồi được lập bản đồ di truyền ở quãng phân tử có độ lớn 530-kb trong quần thể 220 dòng con lai tái tổ hợp thông qua bản đồ linkage. Bên cạnh đó, kết quả functional annotation, phổ biểu hiện gen, và phân tích biến thiên trình tự DNA khẳng định men anthocyanin reductase (được mã hóa bởi gen Arahy.IK60LM) gần như là gen ứng cử viên đối với ahRt2. Người ta thấy có một chỉ thị SNP trong exon thứ ba của ahRt2 bị thay đổi khi mã hóa chuỗi amino acids, và liên quan chặt đến testa màu đỏ của đậu phụng. Hơn nữa, một chỉ thị phân tử liên kết rất chặt với tính trạng red testa được phát triển phục vụ cho nghiên cứu sau này. Kết quả cung cấp kiến thức mới về cơ chế phân tử của tính trạng vỏ lụa hạt đậu phụng màu đỏ và những marker chẩn đoán hữu ích phục vụ chiến lược MAS trong chọn giống đậu phụng.

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-022-04051-w

 

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Kiểm soát di truyền của khả năng chịu hạn trên đậu nành dại (glycine soja) ở các giai đoạn sinh dưỡng và nảy mầm

  Kiểm soát di truyền của khả năng chịu hạn trên đậu nành dại (glycine soja) ở các giai đoạn sinh dưỡng và nảy mầm DOWNLOAD Thi C u c Nguyen 1 , Hai Anh Tran 1 , Jeong Dong Lee 1 , Hak Soo Seo 2 , Hyun Jo 1 *  và Jong Tae Song 1 * 1  Khoa học Sinh học Ứng dụng, Đại học Quốc gia Kyungpook, Daegu, Hàn Quốc 2  Khoa Nông nghiệp, Lâm nghiệp và Tài nguyên Sinh học, Đại học Quốc gia Seoul, Seoul, Hàn Quốc TÓM TẮT Căng thẳng do hạn hán, đang trở nên phổ biến hơn do biến đổi khí hậu, là một yếu tố phi sinh học quan trọng ảnh hưởng xấu đến sản lượng cây trồng và tính ổn định của năng suất. Đậu nành trồng ( Glycine max ), một loại cây trồng đa năng cho cả người và động vật, biểu hiện tính nhạy cảm với hạn hán, dẫn đến giảm sinh trưởng và phát triển trong điều kiện hạn hán. Tuy nhiên, một số ít nghiên cứu di truyền đã đánh giá phản ứng của đậu nành dại ( Glycine soja ) đối với căng thẳng hạn hán. Trong công trình này, chúng tôi đã tiến hành một nghiên cứu liên kết toàn bộ h...
Read more

GWAS phân tích đa dạng hàm lượng khoáng chất trong hạt đậu cô ve

GWAS phân tích đa dạng hàm lượng khoáng chất trong hạt đậu cô ve Nguồn:   Jessica Delfini ,  Vânia Moda-Cirino ,  José dos Santos Neto ,  Douglas Mariani Zeffa ,  Alison Fernando Nogueira ,  Luriam Aparecida Brandão Ribeiro ,  Paulo Maurício Ruas ,  Paul Gepts  &  Leandro Simões Azeredo Gonçalves . 2021. Genome-wide association study for grain mineral content in a Brazilian common bean diversity panel .   Theoretical and Applied Genetics  September 2021; vol. 134: 2795–2811     QTNs liên quan đến hàm lượng của chín khoáng chất có trong hạt đậu cô ve được người ta phân lập trong thí nghiệm này. Sự tập hợp của những alen cần thiết gắn liền với sự gia tăng dần lên khoáng chất trong hạt đậu.   Biofortification   (chữa bệnh bằng thực phẩm) là chiến lược khắc phục vấn đề khiếm dưỡng ở những nước đang phát triển, mục đích là nhắm tới cả...
Read more

GWAS tính trạng kháng bệnh thối thân trên tập đoàn giống đậu nành Canada

  Nguồn:   Deus Mugabe , Mohsen Yoosefzadeh-Najafabadi &  Istvan Rajcan . 2024.   Genetic diversity and genome-wide association study of partial resistance to Sclerotinia stem rot in a Canadian soybean germplasm panel . Theoretical and Applied Genetics; August 11 2024; vol.137; article 201  Cải tiến giống đậu nành kháng bệnh là nội dung then chốt trong quản lý bệnh thối thân (Sclerotinia Stem Rot: SSR) của cây đậu nành. Người ta tiến hành phân tích GWAS trên tập đoàn giống đậu nành của Canada, phân lập được liên kết giữa tính trạng với chỉ thị phân tử và gen ứng cử viên, mở đường cho phương pháp chọn giống nhờ chỉ thị phân tử.   Sclerotinia stem rot (SSR) do nấm  Sclerotinia sclerotiorum  gây ra, đây là một trong những pathogen quan trọng bậc nhất làm suy giảm nặng nề năng suất đậu nành tại Canada và trên thế giới. Phát triển giống đậu nành cao sản kháng bệnh thối thân vừa rẻ tiền, vừa đáng tin cậy để quản lý bệnh này. Tuy nhiên, việ...
Read more