Di truyền tính trạng chiều cao cây đậu nành

 Di truyền tính trạng chiều cao cây đậu nành

Nguồn: Javaid Akhter Bhat, Benjamin Karikari, Kehinde Adewole Adeboye, Showkat Ahmad Ganie, Rutwik Barmukh, Dezhou Hu, Rajeev K. Varshney & Deyue Yu. 2022. Identification of superior haplotypes in a diverse natural population for breeding desirable plant height in soybean. Theoretical and Applied Genetics July 2022; vol. 135: 2407–2422

Chiều cao cây đậu nành kết gắn với  một haplotype block trên nhiễm sắc thể 19, được xếp hạng trong 211 mẫu giống đậu nành  thành năm nhóm giống khác nhau hiển thị tính khác biệt có ý nghĩa về tính trạng chiều cao.

Biến thiên di truyền là cơ sở đê cải tiến giống cây trồng. Những quần thể tự nhiên là nguồ vật liệu di truyền đáng quý. Tuy nhiên, các chiến lược có hiệu quả đối với việc sử dụng chúng trong trường hợp tính trạng di truyền số lượng, ví dụ chiều cao cây (PH) rất hiếm hoi. Là một tính trạng nông học quan trọng, chiều cao cây có liên quan chặt với năng suất và phẩm chất hạt, người ta cần phải hiểu thấu đáo cơ chế di truyền của chiều cao cây đậu nành. Ở đây, GWAS được tiếp cận để hoàn thiện việc xác định chỉ thị phẩn tư SNPs liên kết có ý nghĩa với chiều cao cây trong quần thể tự nhiên bao gốm 211 mẫu giống đậu tương trồng trọt, chúng được đánh giá kiểu gen với NJAU 355 K Soy SNP Array và được đánh giá sâu thông qua sáu địa điểm khác nhau. Tổng số chỉ thị SNPs là 128 phân phố đều khắp trên 17 nhiễm sắc thể được tìm thấy có mức độ liên kết có ý nghĩa thống kê với chiều cao cây tại 6 điểm thí nghiệm nói trên. Ba chỉ thị SNPs có ý nghĩa được được xác định ở ít nhấn 3 môi trườngh trên nhiễm sắc thể 2 (AX-93958260), nhiễm sắc thể 17 (AX-94154834), và nhiễm sắc thể 19 (AX-93897200). Vùng đích có kích thước ~ 130 kb tiếp cận với 3 chỉ thị SNPs được xem là những QTLs ổn định, bao gồm 169 gen. Trong đó, có 22 gen (bao gồm gen Dt1) được ưu tiên xem xét và được xác định là ứng cử viên giả định điều khiển chiều cao cây. Vùng trên genome kề  cận với 12 SNPs có ý nghĩa nhất là LD rất mạnh mẽ (linkage disequilibrium). Những chỉ thị phân tử SNPs này hình thành một single haplotype block bao gồm 5 haplotypes đối với tính trạng chiều cao, tên là Hap-A, Hap-B, Hap-C, Hap-D, và Hap-E. Khai thác tích cực những haplotypes ưu việt trong chương trình cải tiến giống đậu nành sẽ cho phép nhà chọn giống phát triển được giống đậu nành cải tiến có chiều cao mong muốn.

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-022-04120-0