Protein CBLL của đậu phộng

 Protein CBLL của đậu phộng

Nguồn: Ren W, Zeng Z, Wang S, Zhang J, Fang J, Wan L. 2022. Global Survey, Expressions and Association Analysis of CBLL Genes in Peanut.  Front Genet. 2022 Mar 9;13:821163. doi: 10.3389/fgene.2022.821163.

 

Cystathionine γ-synthase (CGS), methionine γ-lyase (MGL), cystathionine β-lyase (CBL) và cystathionine γ-lyase (CGL) cùng chia sẻ domain Cys_Met_Meta_PP và có vai trò quan trọng trong phản ứng với stress của thực vật, cũng như phát triển. Theo kết quả nghiên cứu này, người ta xác định được các genmã hóa protein có dmain Cys_Met_Meta_PP (PF01053.20) là gen có tên chuyên môn: CBL-like genes (CBLL). Hai mươi chín gen CBLL được phân lập trong hệ gen cây đậu phọng, bao gồm 12 giống đậu phọng trồng trọt và 17 loài đậu phọng hoang dại. Những gen này phân bố không đồng đều định vị tại những đầu của các nhiễm sắc thể khác nhau. Sự tiến hóa, cấu trúc gen, và phân tích motif cho thấy rằng: protein CBLL có năm nhánh khác nhau mang tính chất tiến hóa. Thành phần phân bố trên nhiễm sắc thể và kết quả phân tích synteny (tính đồng dạng) khẳng định rằng: tính chất tự tái bản của toàn hệ gen (allopolyploidization) góp phần vào sự phát triển các gen CBLL. Phân tích genome theo hướng so sánh cho thấy rằng ba  cặp gen phổ biến nhất CBLL có tính chất đồng tuyến (colinear) có trong cây đậu phọng, cây Arabidopsis, cây nho và cây đậu nành, nhưng cặp gen CBLL không đồng tuyến giữa đậu phọng và cây lúa. Kết quả dự đoán những nguyên tố cis-acting chỉ ra rằng AhCBLLs, AdCBLLs, AiCBLLs chứa đụng những thành phần khác nhau của tăng trưởng thực vật,  stress phi sinh học, hormones thực vật, và nguyên tố phản ứng với ánh sáng. Phổ thể hiện gen theo không gian cho thấy tất cả gen AhCBLLs có biểu hiện cao hơn rất đáng kể trong vỏ hạt đậu và hạt đậu phọng.Tất cả gen AhCBLLs có thể phản ứng với stress nóng, một vài gen có thể bị kích hoạt nhanh bởi nhiệt độ lạnh, mặn, ngập, nhiệt độ nóng và khô hạn. Hơn nữa, một vị trí đa hình trong vùng phân tử AiCBLL7 được phân lập bở phân tích association, tình trạng này gắn kết gần với tính trạng chiều dài vỏ hạt PL(pod length), chiều rộng PW (pod width), khối lượng 100 quả (HPW) và khối lượng 100 hạt (HSW). Kết quả nghiên cứu này cho nền tảng kiến thức phục vụ nghiên cứu sâu hơn về chức năng của học gen CBLL của đậu phọng.

Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35356435/

 

Hình: Vị trí trên nhiễm sắc thể gen CBLL. Các vị trí trên nhiễm sắc thể gen CBLL đậu phọng được vẽ bản đồ theo cơ sở dữ liệu PeanutBase. Màu đỏ là các gen trên loài hoang dại.