GWAS và phổ biểu hiện của họ gen YUCCA cây đậu xanh (Vigna radiata L.)
GWAS và phổ biểu hiện của họ gen YUCCA cây đậu xanh (Vigna radiata L.)
Nguồn Ranran Wu, Jingbin Chen, Yun Lin, Qiyuan Jia, Yingjian Guo, Jinyang Liu, Qiang Yan, Chenchen Xue, Xin Chen, Xingxing Yuan. 2023. Genome-Wide Identification, Expression Analysis, and Potential Roles under Abiotic Stress of the YUCCA Gene Family in Mungbean (Vigna radiata L.)
Int J Mol Sci.; 2023 Jan 13; 24(2):1603. doi: 10.3390/ijms24021603.
YUCCA, thuộc lớp B flavin-dependent monooxygenases, phản ứng xúc tác trong sinh tổng hợp auxin nội sinh, được xem là nội dung điều hòa tăng trưởng cây trồng và phả ứng với stress. Phân tích theo hệ thống họ gen YUCCA, phản ứng với stress của nó giúp chúng ta hiểu được cơ chế điều tiết và ứng dụng trong cải tiến giống đậu xanh. Theo kết quả nghiên cứu, có 12 gen trong họ YUCCA được xác định của hệ gen cây đậu xanh (Vigna radiata L.); người ta đặt tên gen theo mức độ tương đồng với AtYUCCAs. Phân tích di truyền huyết thống cho thấy 12 VrYUCCAs có thể phân ra thành 4 subfamilies. Sự ấy ấy được minh chứng từ các xét nghiệm enzyme in vitro và cây Arabidopsis chuyển nạp gen in vivo. Kết quả cho thấy tất cả gen VrYUCCAs được phân lập có hoạt tính sinh học khi phản ứng với tổng hợp IAA. Phân tích biểu hiện mẫu mực cho thấy mức độ đa dạng chức năng và mức độ đa dạng di truyền của họ gen VrYUCCA. Bốn= gen VrYUCCAs biểu hiện trong hầu hết các mô, năm gen VrYUCCAs biểu hiện đặc biệt cao tại những cơ qua của hoa đậu xanh. Phản ứng với 5 stress,đó là auxin (indole-3-acetic acid, IAA), mặn, khô hạn, nhiệt độ nóng, nhiệt độ lạnh, cũng được xem xét. Năm gen VrYUCCAs phản ứng với IAA ở rễ đậu xanh, trong khi đó, chỉ có một gen VrYUCCA8a được kích hoạt trong lá đậu xanh.
Gen VrYUCCA2a, VrYUCCA6a, VrYUCCA8a, VrYUCCA8b, và VrYUCCA10 biểu hiện tính trội trong phản ứng với stress phi sinh học, vì mức độ mẩn cảm của chúng đối với 4 nghiệm thức nói trên. Tuy nhiên, các modes phản ứng của VrYUCCAs rất thay đổi, cho thấy chúng có thể điều tiết với stress rất khác nhau theo nhiều cách khác nhau để điều chỉnh rất ngoạn mục hàm lượng IAA. Kết quả phân tích VrYUCCAs trong nghiên cứu này là nền tảng kiến thức vững chắc cho nghiên cứu sau này về những cơ chế của họ gen VrYUCCA và ứng dụng trong cải tiến giống.
Comments
Post a Comment