Động thái tiến hóa của họ gen WRKY của các loài thuộc chi Arachis

 Động thái tiến hóa của họ gen WRKY của các loài thuộc chi Arachis 

Nguồn: Mingwei Chen, Meiran Li, Longgang Zhao, Hui Song. 2023. Deciphering evolutionary dynamics of WRKY genes in Arachis species.BMC Genomics; 2023 Jan 27; 24(1):48. doi: 10.1186/s12864-023-09149-z.

 

Giống đậu phụng trồng trọt (Arachis hypogaea), là con lai của tổ tiên giữa A. duranensis x A. ipaensis. Nó là cây trồng cho dầu và protein cực kỳ quan trọng từ Nam Mỹ. Hiện nay, có ít nhất sáu genomes Arachis đã và đang được giải trình tự DNA. Yếu tố phiên mã TF của WRKY có vai trò quan trọng trong tăng trưởng và phát triển; phản ứng với stress sinh học và phi sinh học. WRKY TFs đã được người ta phân lập thành công trong loài A. duranensis, A. ipaensis, và A. hypogaea cv. Tuy nhiên, giống đậu phụng canh tác Tifrunner phản ánh biến dị di truyền của số lần lai và kết quả tiến hóa đối với những loài Arachis spp. còn chưa rõ ràng về giải thích.

 

Yếu tố phiên mã WRKY đã được xác định và được so sánh qua nhiều loài khác nhau của chi Arachis, bao gốm A. duranensis, A. ipaensis, A. monticola, A. hypogaea [giống đậu phụng trồng trọt (cv.) bao gồm giống Fuhuasheng, A. hypogaea cv. Shitouqi, và A. hypogaea cv. Tifrunner]. Kết quả cho thấy yếu tố phiên mã WRKY đã trải qua sự kiện “equilibrium” tích cực giữa loài đậu lưỡng bội và loài tứ bội, được người ta định tính bởi sự mất đi của yếu tố phiên mã rất cũ WRKY và sự giữ lại những cái mới. Đáng kể là, giống đậu phụng trồng trọt đã di truyền mang tính bảo thủ nhiều hơn “những WRKY tương đồng” từ loài hoang dại tứ bội so với tổ tiên lưỡng bội. Phân tích “W-box elements” và phân tích tương tác protein x protein cho thấy tiến trình thuần hóa khác nhau đã ảnh hưởng đến sự tiến hóa của WRKY trong các dòng đậu phụng canh tác. Yếu tố phiên mã WRKY của A. hypogaea cv.; giống đậu phụng Fuhuasheng và Shitouqi biểu hiện một tiến trình thuần hóa hết sức giống nhau, trong khi giống đậu phụng Tifrunner đã trải qua tiến trình thuần hóa hết sức khác biệt theo kết quả phân tích tương tác protein x protein.

 

Nghiên cứu này cung cấp kiến thức mới về sự tiến hóa của yếu tố phiên mã WRKY trong loài của chi Arachis.

 

Xemhttps://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36707767/

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Kiểm soát di truyền của khả năng chịu hạn trên đậu nành dại (glycine soja) ở các giai đoạn sinh dưỡng và nảy mầm

  Kiểm soát di truyền của khả năng chịu hạn trên đậu nành dại (glycine soja) ở các giai đoạn sinh dưỡng và nảy mầm DOWNLOAD Thi C u c Nguyen 1 , Hai Anh Tran 1 , Jeong Dong Lee 1 , Hak Soo Seo 2 , Hyun Jo 1 *  và Jong Tae Song 1 * 1  Khoa học Sinh học Ứng dụng, Đại học Quốc gia Kyungpook, Daegu, Hàn Quốc 2  Khoa Nông nghiệp, Lâm nghiệp và Tài nguyên Sinh học, Đại học Quốc gia Seoul, Seoul, Hàn Quốc TÓM TẮT Căng thẳng do hạn hán, đang trở nên phổ biến hơn do biến đổi khí hậu, là một yếu tố phi sinh học quan trọng ảnh hưởng xấu đến sản lượng cây trồng và tính ổn định của năng suất. Đậu nành trồng ( Glycine max ), một loại cây trồng đa năng cho cả người và động vật, biểu hiện tính nhạy cảm với hạn hán, dẫn đến giảm sinh trưởng và phát triển trong điều kiện hạn hán. Tuy nhiên, một số ít nghiên cứu di truyền đã đánh giá phản ứng của đậu nành dại ( Glycine soja ) đối với căng thẳng hạn hán. Trong công trình này, chúng tôi đã tiến hành một nghiên cứu liên kết toàn bộ h...
Read more

GWAS phân tích đa dạng hàm lượng khoáng chất trong hạt đậu cô ve

GWAS phân tích đa dạng hàm lượng khoáng chất trong hạt đậu cô ve Nguồn:   Jessica Delfini ,  Vânia Moda-Cirino ,  José dos Santos Neto ,  Douglas Mariani Zeffa ,  Alison Fernando Nogueira ,  Luriam Aparecida Brandão Ribeiro ,  Paulo Maurício Ruas ,  Paul Gepts  &  Leandro Simões Azeredo Gonçalves . 2021. Genome-wide association study for grain mineral content in a Brazilian common bean diversity panel .   Theoretical and Applied Genetics  September 2021; vol. 134: 2795–2811     QTNs liên quan đến hàm lượng của chín khoáng chất có trong hạt đậu cô ve được người ta phân lập trong thí nghiệm này. Sự tập hợp của những alen cần thiết gắn liền với sự gia tăng dần lên khoáng chất trong hạt đậu.   Biofortification   (chữa bệnh bằng thực phẩm) là chiến lược khắc phục vấn đề khiếm dưỡng ở những nước đang phát triển, mục đích là nhắm tới cả...
Read more

GWAS tính trạng kháng bệnh thối thân trên tập đoàn giống đậu nành Canada

  Nguồn:   Deus Mugabe , Mohsen Yoosefzadeh-Najafabadi &  Istvan Rajcan . 2024.   Genetic diversity and genome-wide association study of partial resistance to Sclerotinia stem rot in a Canadian soybean germplasm panel . Theoretical and Applied Genetics; August 11 2024; vol.137; article 201  Cải tiến giống đậu nành kháng bệnh là nội dung then chốt trong quản lý bệnh thối thân (Sclerotinia Stem Rot: SSR) của cây đậu nành. Người ta tiến hành phân tích GWAS trên tập đoàn giống đậu nành của Canada, phân lập được liên kết giữa tính trạng với chỉ thị phân tử và gen ứng cử viên, mở đường cho phương pháp chọn giống nhờ chỉ thị phân tử.   Sclerotinia stem rot (SSR) do nấm  Sclerotinia sclerotiorum  gây ra, đây là một trong những pathogen quan trọng bậc nhất làm suy giảm nặng nề năng suất đậu nành tại Canada và trên thế giới. Phát triển giống đậu nành cao sản kháng bệnh thối thân vừa rẻ tiền, vừa đáng tin cậy để quản lý bệnh này. Tuy nhiên, việ...
Read more