Kết quả GWAS trong phân lập gen kháng bệnh cháy lá do vi khuẩn của đậu nành

 Kết quả GWAS trong phân lập gen kháng bệnh cháy lá do vi khuẩn của đậu nành

Nguồn: Fangzhou Zhao, Yanan Wang, Wei Cheng, Augustine Antwi-Boasiako, Wenkai Yan, Chunting Zhang, Xuewen Gao, Jiejie Kong, Wusheng Liu, Tuanjie Zhao. 2025. Genome-Wide Association Study of Bacterial Blight Resistance in Soybean. Plant Dis.; 2025 Feb; 109(2):341-351. doi: 10.1094/PDIS-01-24-0162-RE.

Bệnh cháy lá do vi khuẩn (bacterial blight) do Pseudomonas syringae pv. glycinea (Psg) gây ra với đốm lá lan rộng. Bốn gen kháng vi khuẩn được ký hiệu là (Rpg) từ 1 đến 4 được người ta ghi nhận  với tỷ lệ con lai phân ly theo luật Mendel; nhưng cơ sở di truyền số lượng của các gen kháng vẫn còn chưa rõ. Trong nghiên cứu này, tính kháng bệnh Psg của 2 tập đoàn giống đậu nành bao gồm 573 và 213 mẫu giống, được đánh giá kiểu hình trên nhiều môi trường canh tác khác nhau, năm 2014 đến 2016. GWAS (genome-wide association study) được thức hiện nhờ hai mô hình toán: FarmCPU và BLINK, để xác định được loci điều khiển tính kháng bệnh Psg. Có tất cả 40 giống đậu nành biểu thị tính kháng cao với Psg, có 14 QTLs (quantitative trait loci) được tìm thấy trên 12 nhiễm sắc thể đậu nành. Những QTLs này được phân lập lần đầu tiên. Những QTLs chủ lực chỉ được tìm thấy trong một tập đoàn hoặc trong tập đoàn giống khác, trong khi đó, qRPG-18-1 được tìm thấy trong cả hai tập đoàn giống đối với nhất một vụ đậu nành. Có tất cả 46 gen ứng cử viến kháng bệnh Psg được người ta xác định từ loci qRpg_13_1, qRPG-15-1, và qRPG-18-1 trên cơ sở phần mềm “gene function annotation”. Hơn nữa, người ta thấy vùng mang gen đích trong vùng genome rpg1-b và rpg1-r mang tính chất đồng dạng di truyền (synteny) với một vùng genome khác trên nhiễm sắc thể 15; xác định được 16 gen mã hóa NBS-LRR (nucleotide binding site-leucine-rich repeat) như những gen ứng cử viên kháng bệnh Psg từ trong những “synteny blocks” như vậy. Kết quả cung cấp nguồn thông tin mới đối với điều khiển di truyền tính kháng bệnh Psg của cây đậu nành.

Xem https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39254851/

Comments

Post a Comment

Popular posts from this blog

Kiểm soát di truyền của khả năng chịu hạn trên đậu nành dại (glycine soja) ở các giai đoạn sinh dưỡng và nảy mầm

  Kiểm soát di truyền của khả năng chịu hạn trên đậu nành dại (glycine soja) ở các giai đoạn sinh dưỡng và nảy mầm DOWNLOAD Thi C u c Nguyen 1 , Hai Anh Tran 1 , Jeong Dong Lee 1 , Hak Soo Seo 2 , Hyun Jo 1 *  và Jong Tae Song 1 * 1  Khoa học Sinh học Ứng dụng, Đại học Quốc gia Kyungpook, Daegu, Hàn Quốc 2  Khoa Nông nghiệp, Lâm nghiệp và Tài nguyên Sinh học, Đại học Quốc gia Seoul, Seoul, Hàn Quốc TÓM TẮT Căng thẳng do hạn hán, đang trở nên phổ biến hơn do biến đổi khí hậu, là một yếu tố phi sinh học quan trọng ảnh hưởng xấu đến sản lượng cây trồng và tính ổn định của năng suất. Đậu nành trồng ( Glycine max ), một loại cây trồng đa năng cho cả người và động vật, biểu hiện tính nhạy cảm với hạn hán, dẫn đến giảm sinh trưởng và phát triển trong điều kiện hạn hán. Tuy nhiên, một số ít nghiên cứu di truyền đã đánh giá phản ứng của đậu nành dại ( Glycine soja ) đối với căng thẳng hạn hán. Trong công trình này, chúng tôi đã tiến hành một nghiên cứu liên kết toàn bộ h...
Read more

GWAS phân tích đa dạng hàm lượng khoáng chất trong hạt đậu cô ve

GWAS phân tích đa dạng hàm lượng khoáng chất trong hạt đậu cô ve Nguồn:   Jessica Delfini ,  Vânia Moda-Cirino ,  José dos Santos Neto ,  Douglas Mariani Zeffa ,  Alison Fernando Nogueira ,  Luriam Aparecida Brandão Ribeiro ,  Paulo Maurício Ruas ,  Paul Gepts  &  Leandro Simões Azeredo Gonçalves . 2021. Genome-wide association study for grain mineral content in a Brazilian common bean diversity panel .   Theoretical and Applied Genetics  September 2021; vol. 134: 2795–2811     QTNs liên quan đến hàm lượng của chín khoáng chất có trong hạt đậu cô ve được người ta phân lập trong thí nghiệm này. Sự tập hợp của những alen cần thiết gắn liền với sự gia tăng dần lên khoáng chất trong hạt đậu.   Biofortification   (chữa bệnh bằng thực phẩm) là chiến lược khắc phục vấn đề khiếm dưỡng ở những nước đang phát triển, mục đích là nhắm tới cả...
Read more

GWAS tính trạng kháng bệnh thối thân trên tập đoàn giống đậu nành Canada

  Nguồn:   Deus Mugabe , Mohsen Yoosefzadeh-Najafabadi &  Istvan Rajcan . 2024.   Genetic diversity and genome-wide association study of partial resistance to Sclerotinia stem rot in a Canadian soybean germplasm panel . Theoretical and Applied Genetics; August 11 2024; vol.137; article 201  Cải tiến giống đậu nành kháng bệnh là nội dung then chốt trong quản lý bệnh thối thân (Sclerotinia Stem Rot: SSR) của cây đậu nành. Người ta tiến hành phân tích GWAS trên tập đoàn giống đậu nành của Canada, phân lập được liên kết giữa tính trạng với chỉ thị phân tử và gen ứng cử viên, mở đường cho phương pháp chọn giống nhờ chỉ thị phân tử.   Sclerotinia stem rot (SSR) do nấm  Sclerotinia sclerotiorum  gây ra, đây là một trong những pathogen quan trọng bậc nhất làm suy giảm nặng nề năng suất đậu nành tại Canada và trên thế giới. Phát triển giống đậu nành cao sản kháng bệnh thối thân vừa rẻ tiền, vừa đáng tin cậy để quản lý bệnh này. Tuy nhiên, việ...
Read more