GWAS phân lập được gen ứng cử viên điều khiển tập tính tăng trưởng đậu chickpea

 GWAS phân lập được gen ứng cử viên điều khiển tập tính tăng trưởng đậu chickpea

Nguồn: Rajib Kumbhakar, Mayulika Mondal, Virevol Thakro, Yashwant K. Yadava, Uday Chand Jha, Shailesh Tripathi & Swarup K. Parida. 2026. A genome-wide association analysis identifies a key candidate gene controlling plant growth habit in chickpea. TAG; January 3 2026; vol. 139; article 22

Tích hợp kết quả GWAS và phân tích haplotype đã xác định được một locus chủ chốt điều khiển tính trạng PHG (growth habit: tập tính tăng trưởng) của đậu chickpea.

Xác định những markers phân tử cho tính trạng PHG này sẽ có thể giúp chúng ta biết được khả năng thu hoạch cơ giới; đây là nguyên tắc cơ bản của hiệu quả đột phá năng suất, sản lượng cây trồng trong điều kiện biến đổi khí hậu và gia tăng nhu cầu lương thực toàn cầu. Kết hợp chiến lược chọn giống nhờ GWAS thông qua bản đồ di truyền “association mapping” và kết quả phân tích association trên cơ sở “haplotype”, phương pháp “haplotyping” phân tử và kết quả phân tích biểu hiện gen của tập đoàn bao gồm 286 mẫu giống đậu chickpea (Cicer arietinum), người ta tìm ra cơ sở di truyền của các tính trạng liên quan đến PGH. Người ta ứng dụng 382.171 chỉ thị SNPs có từ WGS (whole-genome sequencing) của mẫu giống chickpea, đó là 286 loại hình desi và kabuli. Người ta khoanh vùng tại một locus chính có lien quan đến biến thể của tính trạng PGH, đặc biệt là giữa kiểu hình mọc đứng : erect (E)/semi-erect (SE) so sánh với kiểu hình mọc bò: spreading (S)/semi-spreading (SS). Trong loci này, gen CaPAR1 (Cicer arietinum PAR1) và những alleles/haplotypes dẫn xuất tự nhiên của nó được xác định là gen ứng cử viên. Kết quả có thể giúp chúng ta sáng tạo nên giống mới cao sản, mọc đứng erect/semi-erect, giống cho phép thu hoạch cơ giới thông qua nghiên cứu genomics và chọn giống phân tử giống đậu chickpea.

Xem https://link.springer.com/article/10.1007/s00122-025-05121-5