Posts

Showing posts from August, 2022

Protein CBLL của đậu phộng

Image
 Protein CBLL của đậu phộng Nguồn: Ren W, Zeng Z, Wang S, Zhang J, Fang J, Wan L. 2022. Global Survey, Expressions and Association Analysis of CBLL Genes in Peanut.  Front Genet. 2022 Mar 9;13:821163. doi: 10.3389/fgene.2022.821163.   Cystathionine γ-synthase ( CGS ), methionine γ-lyase ( MGL ), cystathionine β-lyase ( CB L) và cystathionine γ-lyase ( CGL ) cùng chia sẻ domain Cys_Met_Meta_PP và có vai trò quan trọng trong phản ứng với stress của thực vật, cũng như phát triển. Theo kết quả nghiên cứu này, người ta xác định được các genmã hóa protein có dmain Cys_Met_Meta_PP (PF01053.20) là gen có tên chuyên môn: CBL- like genes ( CBLL ) . Hai mươi chín gen CBLL được phân lập trong hệ gen cây đậu phọng, bao gồm 12 giống đậu phọng trồng trọt và 17 loài đậu phọng hoang dại. Những gen này phân bố không đồng đều định vị tại những đầu của các nhiễm sắc thể khác nhau. Sự tiến hóa, cấu trúc gen, và phân tích motif cho thấy rằng: protein CBLL có năm nhánh khác nhau mang tính...

Cải tiến giống đậu phọng – Kỷ nguyên OMICS

  Cải tiến giống đậu phọng – Kỷ nguyên OMICS Nguồn: Ajilogba CF, Olanrewaju OS, Babalola OO. 2022. Improving Bambara Groundnut Production: Insight Into the Role of Omics and Beneficial Bacteria. Front Plant Sci. 2022 Mar 2;13:836133. doi: 10.3389/fpls.2022.836133. Với sự bùng nổ dân số trên toàn thế giới, những nguy cơ trong môi trường do phân hóa học, sự suy giảm nguồn cung cấp thực phẩm do biến đổi khí hậu, an ninh lương thực đã và đang trở nên ngày càng thường trực. Bên cạnh đó, đất nông nghiệp mất dần do đô thị hóa. Vì vậy, người ta phải định hướng từ ngay bây giờ sự gia tăng dân số song hành cùng những yếu tố khác, lương thực thực phẩm sẽ không còn đầy đủ cho toàn cầu. Do đó, người ta cần phải có phương pháp tiếp cận quyết liệt hơn để cải tiến nông sản cũng như đáp ứng sự bền vững trong phát triển của con người. Ứng dụng phương pháp bền vững môi trường sinh thái, ví dụ sử dụng các vi khuển có lợi, và chọn giống cây họ Đậu cải tiến độ phì nhiêu của đất là một trong những các...

Di truyền tính kháng virus gây bệnh “bud necrosis” do vector bọ trĩ trên đậu phông

 Di truyền tính kháng virus gây bệnh “bud necrosis” do vector bọ trĩ trên đậu phông Nguồn: Mahanta DK, Jangra S, Priti, Ghosh A, Sharma PK, Iquebal MA, Jaiswal S, Baranwal VK, Kalia VK, Chander S. 2022. Groundnut Bud Necrosis Virus Modulates the Expression of Innate Immune, Endocytosis, and Cuticle Development-Associated Genes to Circulate and Propagate in Its Vector, Thrips palmi . Front Microbiol. 2022 Mar 17;13:773238. doi: 10.3389/fmicb.2022.773238. Bọ trĩ Thrips palmi (Thysanoptera: Thripidae) là vec tơ truyền bệnh siêu vi có thuật ngữ khoa học “predominant tospovirus” Ở vùn châu Á Thái Bình Dương. Bệnb gây thiệt hại nặng cho vùng canh tác đậu phọng, đó là GBNV (viết tắt từ chữ groundnut bud necrosis virus, họ siêu vi Tospoviridae ) thuộc loại hình bệnh lây nhiễm thường xuyên (persistent propagative). Bọ trĩ là ký chủ luân phiên, sự duy trì thường trực nguồn siêu vi trong bọ trĩ làm cho việc quản lý bệnh này trở nên rất thách thức cho nhà bảo vệ thực vật. Thuốc trừ bọ trĩ v...

Tổng quan hệ gen cây đậu nành phục vụ cho cải tiến giống

  Tổng quan hệ gen cây đậu nành phục vụ cho cải tiến giống Nguồn: François Belzile ,  Martine Jean ,  Davoud Torkamaneh , Aurélie Tardivel, Marc-André Lemay, Chiheb Boudhrioua,  Geneviève Arsenault-Labrecque , Chloe Dussault-Benoit, Amandine Lebreton,  Maxime de Ronne , Vanessa Tremblay,  Caroline Labbé , Louise O’Donoughue, Vincent-Thomas Boucher St-Amour, Tanya Copley, Eric Fortier, Dave T. Ste-Croix,  Benjamin Mimee , Elroy Cober,  Istvan Rajcan ,  Tom Warkentin , Éric Gagnon, Sylvain Legay, Jérôme Auclair and  Richard Bélanger . 2022. The SoyaGen Project: Putting Genomics to Work for Soybean Breeders. Front. Plant Sci ., 26 April 2022 Dự án SoyaGen là một cố gắng tập thể của các nhà chọn giống đậu nành Canada và các nhà khoa học thuộc viện hàn lâm hoặc của tư nhân cũng như cộng tác viên quốc tế. Dự án này nhằm mục đích phát triển các giải pháp mang tính ...

AhRT2  là gen ứng cử viên của tính trạng màu vỏ lụa đỏ của hạt đậu phụng

 AhRT2  là gen ứng cử viên của tính trạng màu vỏ lụa đỏ của hạt đậu phụng Nguồn: Kun Zhang ,  Mei Yuan ,  Han Xia ,  Liangqiong He ,  Jing Ma ,  Mingxiao Wang ,  Huiling Zhao ,  Lei Hou ,  Shuzhen Zhao ,  Pengcheng Li ,  Ruizheng Tian ,  Jiaowen Pan ,  Guanghui Li ,  Mahendar Thudi ,  Changle Ma ,  Xingjun Wang  &  Chuanzhi Zhao . 2022. BSA‑seq and genetic mapping reveals  AhRt2  as a candidate gene responsible for red testa of peanut. Theoretical and Applied Genetics : May 2022; vol. 135: 1529–1540 Gen lặn ứng cử viên  a hRt2  có chức năng điều khiển tính trạng màu vỏ lụa đỏ (red testa) của đậu phụng thông qua kết quả phối hợp của BSA-seq và bản đồ liên kết. Màu vỏ lụa đỏ (testa color) của đậu phụng ( Arachis hypogaea  L.) la tính trạng nông học quan trọng, red testa đặc biệt phổ biến theo thị hiếu người tiêu dùng, là kết quả của hàm lượng cao anth...

QTL điều khiển khối lượng hạt đậu phụng

 QTL điều khiển khối lượng hạt đậu phụng Nguồn: Zhihui Wang ,  Liying Yan ,  Yuning Chen ,  Xin Wang ,  Dongxin Huai ,  Yanping Kang ,  Huifang Jiang ,  Kede Liu ,  Yong Lei  &  Boshou Liao . 2022.  Detection of a major QTL and development of KASP markers for seed weight by combining QTL-seq, QTL-mapping and RNA-seq in peanut. Theoretical and Applied Genetics ; May 2022; vol. 135: 1779–1795 Người ta kết hợp kết quả QTL-seq, QTL-mapping và RNA-seq phân lập được một QTL chủ lực và những gen ứng cử viên, tham gia vào nội dung phát triển chỉ thị phân tử KASP và hiểu rõ những cơ chế phân tử liên quan đến tính trạng khối lượng hạt đậu phụng. Khối lượng hạt là tính trạng quan trọng của thành phần năng suất,  rất có ý nghĩa trong chọn tạo giống đậu phụng cao sản. Tuy nhiên, người ta biết rất ít về những QTL (quantitative trait loci) và gen ứng cử viên liên quan đến khối lượng hạt đậu phụng. Theo kết quả nghiên c...

Cải tiến hiệu suất quang hợp, chỉ số thu hoạch giống đậu nành cao sản

 Cải tiến hiệu suất quang hợp, chỉ số thu hoạch giống đậu nành cao sản Nguồn: Miguel Angel Lopez ,  Fabiana Freitas Moreira ,  Anthony Hearst ,  Keith Cherkauer  &  Katy Martin Rainey . 2022. Physiological breeding for yield improvement in soybean: solar radiation interception-conversion, and harvest index. Theoretical and Applied Genetics  May 2022; vol. 135: 1477–1491 Hiệu quả hấp thu ánh sáng, hiệu quả sử dụng quang hợp và chỉ số thu hoạch (HI) có thể được sử dụng như những tiêu chí để đánh giá sự cải tiện tiềm năng về năng suất đậu nành. Năng suất (GY) có thể được giải thích như là kết quả của 3 hiệu quả chủ lực: hấp thu ánh sáng (light interception: Ei ), sử dụng năng lượng bức xạ (radiation use: RUE) , và chỉ số thu hoạch (harvest index: HI ). Mặc dù khái niệm năng suất GY thông qua 3 hiệu quả nói trên không mới, nhưng người ta rất thiếu hiểu biết cặn kẽ về chúng, một lổ hổng kiến thức về biến thiên kiểu hình, kiến trúc di tru...

Di truyền tính kháng nấm Sclerotinia của cây đậu nành (Glycine max)

  Di truyền tính kháng nấm Sclerotinia của cây đậu nành (Glycine max) Nguồn: Wei Wei ,  Xing Wu ,  Laureen Blahut-Beatty ,  Daina H. Simmonds , and  Steven J. Clough . 2022. Transcriptome Profiling Reveals Molecular Players in Early Soybean–Sclerotinia sclerotiorum Interaction . APS Publication; Genetics and Genomics of Resistance. On line July 1 2022; Nấm Sclerotinia sclerotiorum   gây ra bệnh thối thân (Sclerotinia stem rot) của cây đậu nành. Sử dụng phương pháp RNA sequencing, phân tích transcriptomes đối với cây đậu nành và nấm gây bệnh  S. sclerotiorum   cùng một lúa nhằm xác định tương tác ký chủ x ký sinh ở giai đoạn 4 và 8 giờ sau khi chủng nguồm nấm bệnh. Vật liệu bao gồm hai giống đậu nành: giống  chuyển gen “ resistant oxalate oxidase (OxO) ” kháng bệnh và giống nhiễm, AC Colibri (AC). Trong 594 gen các tác động làm giảm bệnh do nấm  S. sclerotiorum , cả hai cây chủ đều biểu hiện gen có liên quan đến jasmonic acid, e...

Chỉnh sửa gen cây đậu phụng bằng hệ thống CRISPRCas9

Image
  Chỉnh sửa gen cây đậu phụng bằng hệ thống CRISPRCas9 Anjanasree K Neelakandan ,  Binita Subedi ,  Sy M Traore ,  Papias Binagwa ,  David A Wright ,  Guohao He . 2022. Base Editing in Peanut Using CRISPR/nCas9. Front Genome Ed.; 2022 May 12;4: 901444 Đậu phụng ( Arachis hypogaea  L.), một loài cây họ Đậu có tính chất dị tứ bội thể (allotetraploid) họ  Fabaceae. Đậu phụng có thể thích nghi vùng nhiệt đới, cận nhiệt đới, được xem như cây cho dầu thực vật triển vọng trên toàn thế giới. Gia tăng hàm lượng oleic acid trở thành một trong những mục đích lớn của chương trình cải tiến giống đậu phụng bởi vì lợi ích cho sức khỏe nhân loại, làm giảm hàm lượng cholesterol trong máu, có tính chất antioxidant và có lợi cho công nghiệp như tính chất để sản phẩm được lâu hơn. Genomic sequencing hệ gen cây đậu phụng cho thấy chứng cứ của gen đồng dạng  AhFAD2A  và  AhFAD2B  mã hóa Fatty Acid Desaturase2 ( FAD2 ) , chúng có chức năng xúc tác...

Di truyền tính trạng chiều cao cây đậu nành

  Di truyền tính trạng chiều cao cây đậu nành Nguồn: Javaid Akhter Bhat, Benjamin Karikari, Kehinde Adewole Adeboye, Showkat Ahmad Ganie, Rutwik Barmukh, Dezhou Hu, Rajeev K. Varshney & Deyue Yu. 2022. Identification of superior haplotypes in a diverse natural population for breeding desirable plant height in soybean. Theoretical and Applied Genetics July 2022; vol. 135: 2407–2422 Chiều cao cây đậu nành kết gắn với  một haplotype block trên nhiễm sắc thể 19, được xếp hạng trong 211 mẫu giống đậu nành  thành năm nhóm giống khác nhau hiển thị tính khác biệt có ý nghĩa về tính trạng chiều cao. Biến thiên di truyền là cơ sở đê cải tiến giống cây trồng. Những quần thể tự nhiên là nguồ vật liệu di truyền đáng quý. Tuy nhiên, các chiến lược có hiệu quả đối với việc sử dụng chúng trong trường hợp tính trạng di truyền số lượng, ví dụ chiều cao cây (PH) rất hiếm hoi. Là một tính trạng nông học quan trọng, chiều cao cây có l...

Di truyền tính trạng phản ứng với auxin trong cây đậu phụng (Arachis hypogaea L.)

  Di truyền tính trạng phản ứng với auxin trong cây đậu phụng ( Arachis hypogaea L.) Nguồn: Luo L, Wan Q, Yu Z, Zhang K, Zhang X, Zhu S, Wan Y, Ding Z, Liu F. 2022. Genome-Wide Identification of Auxin Response Factors in Peanut (Arachis hypogaea L.) and Functional Analysis in Root Morphology. Int J Mol Sci. 2022 May 10; 23(10):5309. Các yếu tố phản ứng với auxin ARFs (auxin response factors) có vai trò quan trọng trong tăng trưởng và phát triển của cây; tuy nhiên, nghiên cứu sự kiện này trong đậu phụng ( Arachis hypogaea  L.) vẫn còn thiếu. Ở đây, người ta phân lập 63, 30, và 30  AhARF  genes, từ giống đậu phụng dị tứ bội  và hai mẫu giống tổ tiên của chúng, lưỡng bội thể ( A .  duranensis  và  A .  ipaensis ). Phân tích cây gia hệ và cấu trúc gen đích cho thấy hầu hết các gen  AhARF s có mức độ giống nhau rất cao so sánh với tổ tiên của chúng. Thực hiện phương pháp scanning toàn bộ hệ gen đối với ARF-recognized...